Ошибка набора инструментов SRA при использовании предварительной выборки

Я установил набор инструментов SRA, используя следующие команды:

компакт-диск ~/Загрузки

wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/s/sra-sdk/sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

sudo apt-get install ./libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
sudo apt-get install ./libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb

кошка <<ЕОФ | sudo тройник /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs 
Пакет: libncbi-vdb2 
Пин: версия 2.9.3+dfsg-2 
Пин-приоритет: 1337

Пакет: libncbi-wvdb2 
Пин: версия 2.9.3+dfsg-2 
Пин-приоритет: 1337 
EOF

sudo apt-get install ./sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

После установки я загрузил файл SRA, и когда я попытался загрузить другой файл SRA, он выдал следующую ошибку:

prefetch:` ошибка поиска символа: /lib/x86_64-linux-gnu/libncbi-vdb.so.2: неопределенный символ: vdb_mbedtls_md_setup

Как я могу это решить?

Похоже, вы следуете мой ответ. Написано 1,5 года назад. Что-то может измениться.

Согласно с https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/546 вам необходимо удалить эту локально установленную версию SRA,

sudo rm /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs
sudo apt-get purge --autoremove libncbi-vdb2 libncbi-wvdb2 sra-toolkit

и установить последнюю версию из https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software вместо.