Рейтинг:0

Как я могу установить VEP (Ensembl Variant Effect Predictor)?

флаг cn

Я пытаюсь установить VEP через это суть. У меня нет conda, поэтому сначала я пытаюсь установить его в $HOME/миниконда3 как уже упоминалось:

curl -sL https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh -o /tmp/miniconda.sh
ш /tmp/miniconda.sh -bfp $HOME/miniconda3

После запуска вышеуказанных команд я получаю эту ошибку:

sh: 0: Не удается открыть /tmp/miniconda.sh

Если бы вы могли помочь мне решить мою проблему, я был бы более чем благодарен!

Рейтинг:1
флаг de

Краткий ответ на ваш вопрос:

Попробуйте сделать chmod +x /tmp/miniconda.sh затем повторно запустить ш /tmp/miniconda.sh -bfp $HOME/miniconda3

Эта команда делает исполняемый. Затем повторно запустите команду.

Другой способ загрузить и установить miniconda (такой же, как conda, только для командной строки):

Если вы хотите получить миниконду, я предлагаю загрузить последнюю версию файл из здесь.

затем беги chmod +x загруженноеимя_файла.sh

и, наконец, выполните его: ./скачанноеимя_файла.sh.

флаг cn
Большое спасибо, это сработало!
Sadra Naddaf avatar
флаг de
Не за что! пожалуйста, выберите ответ как принятый или отдайте свой голос, чтобы другие могли быть уверены в этом @eleni.ps

Ответить или комментировать

Большинство людей не понимают, что склонность к познанию нового открывает путь к обучению и улучшает межличностные связи. В исследованиях Элисон, например, хотя люди могли точно вспомнить, сколько вопросов было задано в их разговорах, они не чувствовали интуитивно связи между вопросами и симпатиями. В четырех исследованиях, в которых участники сами участвовали в разговорах или читали стенограммы чужих разговоров, люди, как правило, не осознавали, что задаваемый вопрос повлияет — или повлиял — на уровень дружбы между собеседниками.